Πρόκειται για σπάνιο γεωλογικό φαινόμενο, γνωστες και ως "υπόγειες καταβρόθες". Οι μπλε τρύπες δημιουργήθηκαν την εποχή των παγετώνων όταν η στάθμη της θάλασσας ήταν πολύ χαμηλότερη από την σημερινή (100-200 μέτρα χαμηλότερη).

Η διάβρωση ασβεστολιθικών πετρωμάτων, που βρίσκονταν στην επιφάνεια, δημιούργησε καταβόθρες που κατέληγαν σε υπόγεια κοιλώματα. Όταν η στάθμη της θάλασσας ανέβηκε, οι καταβόθρες βρέθηκαν κάτω από την επιφάνειά της κι έτσι δημιουργήθηκε το εντυπωσιακό αυτό φαινόμενο.Στο Μπελίζ βρίσκεται η διασημότερη και η ομορφότερη μπλε τρύπα στον κόσμο.